Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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