Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms