Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms