Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms