Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms