Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms