Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB2P29033 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms