Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms