Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT3O75175 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms