Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms