Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLF12Q9Y4X4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLF12Q9Y4X4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms