Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms