Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms