Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TRIM63Q969Q1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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