Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms