Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME3Q16798 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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