Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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