Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms