Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms