Protein–RNA interactions for Protein: P52569

SLC7A2, Cationic amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A2P52569 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC7A2P52569 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC7A2P52569 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms