Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPM2P07951 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPM2P07951 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms