Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFLP07196 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms