Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA4O75335 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms