Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASKO14936 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASKO14936 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASKO14936 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASKO14936 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms