Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms