Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms