Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5RAP2Q96SN8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms