Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A2Q96QD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC38A2Q96QD8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms