Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms