Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf89Q6UX73 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf89Q6UX73 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms