Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SPATA8Q6RVD6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SPATA8Q6RVD6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms