Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRADDQ15628 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRADDQ15628 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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