Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TLR1Q15399 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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