Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PTPRJQ12913 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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