Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.114e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.94e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 416.02■□□□□ 0.164e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-8■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 EIF4H-204ENST00000489484 831 ntTSL 212.49□□□□□ -0.411e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.474e-8■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 15.3
ILF3Q12906 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-8■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.834e-8■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-8■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-7■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 215.47■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 15.3
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ILF3Q12906 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.921e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.375e-32■■■□□ 15.2
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ILF3Q12906 TMEM165-203ENST00000506103 572 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 TMEM165-212ENST00000608091 1567 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 TMEM165-210ENST00000514904 1522 ntTSL 29.41□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 TMEM165-207ENST00000509575 570 ntTSL 23.65□□□□□ -1.834e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 KDM4C-213ENST00000496464 697 ntTSL 59.62□□□□□ -0.874e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.274e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.694e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 WWTR1-209ENST00000479238 697 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-13■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.072e-13■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 BCORL1-203ENST00000456822 5648 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-9■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AKAP1-209ENST00000572560 442 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-9■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 313.31□□□□□ -0.283e-9■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 511.45□□□□□ -0.583e-9■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.991e-7■■■□□ 15.2
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