Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms