Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11AP62491 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms