Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NGFRP08138 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms