Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNPHO15079 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNPHO15079 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNPHO15079 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNPHO15079 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNPHO15079 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNPHO15079 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNPHO15079 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms