Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms