Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RCE1Q9Y256 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms