Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIQ6

LNPEP, Leucyl-cystinyl aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPEPQ9UIQ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LNPEPQ9UIQ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LNPEPQ9UIQ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms