Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUAP1Q96AJ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUAP1Q96AJ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms