Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DNTTIP2-203ENST00000460191 3084 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.489e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.369e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.349e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.269e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.559e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-206ENST00000533011 733 ntTSL 511.58□□□□□ -0.569e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 39.67□□□□□ -0.869e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 25.64□□□□□ -1.519e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CHMP4A-208ENST00000534106 370 ntTSL 53.59□□□□□ -1.839e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.028e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 312.54□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 SAFB2-210ENST00000591310 722 ntTSL 315.46■□□□□ 0.078e-17■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 SAFB2-211ENST00000592599 2260 ntTSL 212.77□□□□□ -0.378e-17■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 SAFB2-207ENST00000591101 551 ntTSL 29.98□□□□□ -0.818e-17■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 527.67■■■□□ 2.021e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 21e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-15■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.064e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.397e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.957e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.217e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 27.21□□□□□ -1.257e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.337e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 216.81■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.097e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.567e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.887e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 BAZ2A-206ENST00000548578 1002 ntTSL 39.71□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 BAZ2A-209ENST00000549763 657 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-209ENST00000550482 832 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-206ENST00000547708 530 ntTSL 410.99□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 NARS-207ENST00000587675 1002 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-10■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 NARS-206ENST00000587366 515 ntTSL 413.55□□□□□ -0.241e-10■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 NARS-203ENST00000540592 937 ntTSL 212.81□□□□□ -0.361e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 NARS-208ENST00000588661 582 ntTSL 511.68□□□□□ -0.541e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 NARS-211ENST00000590123 463 ntTSL 510.1□□□□□ -0.791e-10■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 27.97□□□□□ -1.138e-15■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TPM3-217ENST00000504663 870 ntTSL 29.64□□□□□ -0.871e-13■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 315.04■□□□□ -01e-6■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-12■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 ETF1-209ENST00000572514 990 ntTSL 518.94■□□□□ 0.625e-14■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.575e-14■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-14■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 ETF1-207ENST00000512198 745 ntTSL 58.43□□□□□ -1.065e-14■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 LMNB1-207ENST00000494185 579 ntTSL 23.07□□□□□ -1.921e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.077e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.187e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.347e-10■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CAPRIN1-204ENST00000526494 399 ntTSL 414.73□□□□□ -0.054e-21■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.569e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 EIF3A-202ENST00000462527 1192 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-13■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HMG20B-206ENST00000453933 759 ntTSL 224.37■■□□□ 1.491e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 HMG20B-204ENST00000417382 561 ntTSL 421.57■■□□□ 1.041e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-22■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CCNL2-220ENST00000505849 1503 ntTSL 215.54■□□□□ 0.082e-22■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.122e-22■□□□□ 9.5
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PUM1Q14671 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 211.7□□□□□ -0.542e-22■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.812e-22■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 224.09■■□□□ 1.454e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AHSA2-205ENST00000471542 1971 ntTSL 213.89□□□□□ -0.194e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AHSA2-210ENST00000493310 402 ntTSL 213.27□□□□□ -0.294e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 DNMT1-205ENST00000585920 529 ntTSL 312.82□□□□□ -0.363e-22■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.874e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.184e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-205ENST00000518218 717 ntTSL 26.51□□□□□ -1.374e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.414e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AHSA2-211ENST00000493628 633 ntTSL 36.15□□□□□ -1.424e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.424e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-204ENST00000517881 359 ntTSL 25.92□□□□□ -1.464e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.464e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.514e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 AHSA2-207ENST00000487904 505 ntTSL 35.5□□□□□ -1.534e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 UBA2-206ENST00000591016 646 ntTSL 23.72□□□□□ -1.814e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-24■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 310.75□□□□□ -0.693e-24■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-24■□□□□ 9.5
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