Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.319e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.039e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 219.56■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SUN1-213ENST00000433212 3474 ntTSL 513.27□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.42■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 318.3■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SNRNP200-202ENST00000429650 2637 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 TPR-207ENST00000491783 882 ntTSL 56.31□□□□□ -1.41e-14■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 217.76■□□□□ 0.436e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 UBE2O-206ENST00000590658 567 ntTSL 410.88□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 214.78□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-323■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt11.86□□□□□ -0.511e-323■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 514.92□□□□□ -0.027e-17■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 514.27□□□□□ -0.137e-17■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 GBA2-207ENST00000488292 646 ntTSL 49.47□□□□□ -0.891e-23■■■■□ 24.3
SF3A3Q12874 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 ACOX2-212ENST00000489472 869 ntTSL 514.79□□□□□ -0.044e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 ACOX2-206ENST00000466810 558 ntTSL 48.08□□□□□ -1.124e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 PLXNB1-210ENST00000467913 688 ntTSL 214.73□□□□□ -0.056e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 PLXNB1-208ENST00000465117 627 ntTSL 313.15□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 HDAC1-208ENST00000482310 779 ntTSL 512.57□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 HDAC1-210ENST00000490081 1047 ntTSL 311.56□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 57.82□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.718e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.718e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.718e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.248e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.128e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 518.64■□□□□ 0.588e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 515.5■□□□□ 0.078e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.078e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-245ENST00000487862 1782 ntTSL 212.03□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-255ENST00000496934 2837 ntTSL 27.27□□□□□ -1.258e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.768e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 310.52□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 48.8□□□□□ -13e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 IL32-224ENST00000534748 580 ntTSL 315.08■□□□□ 02e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 IL32-220ENST00000532086 930 ntTSL 1 (best)15.02■□□□□ -02e-8■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 UBR4-205ENST00000417040 6175 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GUK1-239ENST00000498115 796 ntTSL 517.72■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 24.2
SF3A3Q12874 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.47■□□□□ 0.238e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 POLD1-202ENST00000593407 867 ntTSL 517.99■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 CA5A-202ENST00000566402 725 ntTSL 27.25□□□□□ -1.252e-24■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PLOD3-206ENST00000454310 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.45■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.17■□□□□ 0.347e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.247e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.527e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-212ENST00000514449 760 ntTSL 522.54■■□□□ 1.27e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-205ENST00000505086 811 ntTSL 220.4■□□□□ 0.867e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.837e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-210ENST00000511410 994 ntTSL 218.18■□□□□ 0.57e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-204ENST00000504069 543 ntTSL 516.01■□□□□ 0.157e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-209ENST00000510336 1953 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.577e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 TMCO6-214ENST00000515653 611 ntTSL 311.19□□□□□ -0.627e-8■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 CLASRP-214ENST00000591904 506 ntTSL 515.48■□□□□ 0.074e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 213.25□□□□□ -0.294e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 BRAT1-205ENST00000473879 666 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.959e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.469e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.389e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.359e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 PABPC4-205ENST00000421687 1663 ntTSL 513.25□□□□□ -0.299e-9■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 27.53□□□□□ -1.21e-6■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 24.1
SF3A3Q12874 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 216.74■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 24.1
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