Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPBP07199 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPBP07199 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBP07199 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBP07199 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBP07199 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPBP07199 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms