Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRATO95237 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRATO95237 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRATO95237 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms