Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC69A6NI79 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms