Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms