Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms